Аннотация:
Предложено понятие клеточного автомата с динамической структурой клеточного пространства (ДКА), которое расширяет возможности классических клеточных автоматов (КА) и позволяет применять клеточно-автоматный подход к задачам моделирования роста биологических тканей. ДКА отличаются от классических КА тем, что структура пространства клеток ДКА может изменяться во времени, а межклеточные связи описываются явно при помощи матрицы соседства. Для ДКА также введены оператор вставки и оператор разбиения клеточного массива, позволяющие динамически менять структуру пространства клеток. На основе этого расширения построена ДКА-модель роста апикальной меристемы побега растения Arabidopsis Thaliana, состоящая из параллельной композиции двух ДКА: асинхронного двухмерного ДКА, моделирующего взаиморегуляцию веществ в биологических клетках, и синхронного одномерного ДКА, моделирующего рост и деление этих биологических клеток. Результаты компьютерного моделирования показали, что поведение предложенной ДКА-модели соответствует поведению существующей модели, основанной на композиции дифференциальных уравнений и метода L-системы (системы Линденмайера). Кроме того, предложенная ДКА-модель позволила ввести имитационный рост отдельных биологических клеток, а также визуализировать динамику веществ в этих клетках (распад, диффузию и синтез).
Jacob M. Jepson, Nabil T. Fadai, Reuben D. O'Dea, “Travelling-Wave and Asymptotic Analysis of a Multiphase Moving Boundary Model for Engineered Tissue Growth”, Bull Math Biol, 84:8 (2022)
И. В. Матюшкин, М. А. Заплетина, “Обзор по тематике клеточных автоматов на базе современных отечественных публикаций”, Компьютерные исследования и моделирование, 11:1 (2019), 9–57
О. Л. Бандман, “Дискретная стохастическая модель просачивания жидкости через пористое вещество: особенности параллельной реализации”, Сиб. журн. вычисл. матем., 21:1 (2018), 5–21; O. L. Bandman, “A discrete stochastic model of water permeation through a porous substance: parallel implementation peculiarities”, Num. Anal. Appl., 11:1 (2018), 4–15
Olga Bandman, Encyclopedia of Complexity and Systems Science, 2018, 1
Olga Bandman, Cellular Automata, 2018, 691
О. Л. Бандман, “Клеточно-автоматные модели естественных процессов и их реализация на современных компьютерах”, ПДМ, 2017, № 35, 102–121
Olga Bandman, Encyclopedia of Complexity and Systems Science, 2017, 1
А. А. Витвицкий, “Построение неоднородного массива ячеек для задач клеточно-автоматного моделирования роста и деления клеток бактерий”, ПДМ, 2015, № 3(29), 110–120