Аннотация:
ДНК-последовательностями называются последовательности с элементами из четверичного ДНК-алфавита {A,C,G,T}{A,C,G,T}, существенной особенностью которых является их направленность и способность образовывать дуплексы в результате процесса гибридизации – сращивания двух противоположно направленных последовательностей. В биологических экспериментах, использующих это свойство, необходимым является создание ансамблей таких последовательностей (ДНК-кодов), которые состоят из пар ДНК-последовательностей, называемых дуплексами Ватсона–Крика. Кроме того, энергия гибридизации – мера устойчивости потенциального ДНК-дуплекса – для любых двух слов ДНК-кода, не образующих дуплекс Ватсона–Крика, ограничена сверху некоторым числом, определяемым условиями эксперимента. Такая задача может быть естественным образом интерпретирована в терминах теории кодирования. В продолжение предыдущих работ рассматривается неаддитивная функция сходства двух ДНК-последовательностей, позволяющая наиболее адекватно моделировать энергию их гибридизации. Для максимального объема ДНК-кодов, основанных на таком сходстве, устанавливается верхняя граница Синглтона и приводится пример оптимальной конструкции. С помощью ансамблей ДНК-кодов со специальными ограничениями на кодовые слова (ансамблей Фибоначчи) получена нижняя граница случайного кодирования на максимальный объем ДНК-кодов при указанном сходстве.
Поступила в редакцию: 24.06.2013 После переработки: 16.12.2013
Образец цитирования:
А. Г. Дьячков, А. Н. Кузина, Н. А. Полянский, А. Макула, В. В. Рыков, “ДНК-коды для неаддитивного стебельного сходства”, Пробл. передачи информ., 50:3 (2014), 51–75; Problems Inform. Transmission, 50:3 (2014), 247–269
Yixin Wang, Md Noor-A-Rahim, Erry Gunawan, Yong Liang Guan, Chueh Loo Poh, 2020 IEEE International Symposium on Information Theory (ISIT), 2020, 786
H. Hong, L. Wang, H. Ahmad, J. Li, Y. Yang, Ch. Wu, “Construction of Dna Codes By Using Algebraic Number Theory”, Finite Fields their Appl., 37 (2016), 328–343