Аннотация:
В работе представлено математическое моделирование “из первых принципов” молекулярного переключения на основе реакции изомеризации в молекуле нафталоцианина, индуцированной током сканирующего туннельного микроскопа. Поверхность свободной энергии Гиббса и путь реакции анализируется методом “метадинамики” в рамках численного квантовомеханического кода молекулярной динамики Кар-Парринелло “CPMD”. Расчеты проведены на супер-ЭВМ IBM Blue Gene/P, установленной на факультете ВМК МГУ. Вдоль введенной координационной переменной найдена высота энергетического барьера, который следует преодолеть для прохождения реакции водородной изомеризации. Проведен анализ эволюции электронной плотности в процессе переключения.
Образец цитирования:
Г. Н. Шумкин, А. М. Попов, А. Куриони, Т. Лайно, “Моделирование из первых принципов молекулярного переключателя на основе реакции изомеризации”, Матем. моделирование, 22:11 (2010), 18–28; Math. Models Comput. Simul., 3:3 (2011), 375–381
\RBibitem{ShuPopCur10}
\by Г.~Н.~Шумкин, А.~М.~Попов, А.~Куриони, Т.~Лайно
\paper Моделирование из первых принципов молекулярного переключателя на основе реакции изомеризации
\jour Матем. моделирование
\yr 2010
\vol 22
\issue 11
\pages 18--28
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mm3037}
\transl
\jour Math. Models Comput. Simul.
\yr 2011
\vol 3
\issue 3
\pages 375--381
\crossref{https://doi.org/10.1134/S2070048211030124}
\scopus{https://www.scopus.com/record/display.url?origin=inward&eid=2-s2.0-84885637052}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mm3037
https://www.mathnet.ru/rus/mm/v22/i11/p18
Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
Andrew J. Ilott, Sebastian Palucha, Paul Hodgkinson, Mark R. Wilson, “Well-Tempered Metadynamics as a Tool for Characterizing Multi-Component, Crystalline Molecular Machines”, J. Phys. Chem. B, 117:40 (2013), 12286